• پایش زیستی و غیرزیستی محیطهای دریایی
• مطالعه، پيشبينی و هشدار مخاطرات زیستی و غیر زیستی دريايی ( كشند قرمز، سونامي و ...)
• مشاركت در توسعه فناوریهای نوين دريايي
• مطالعه تغییرات اقلیم و بازسازی اقلیم دیرینه دریاها و اقیانوسها
• بررسيهای بيوسيستماتيك و جغرافيای زيستی فون و فلور دريايي
• مطالعه زیستگاه های حساس ساحلی
پژوهشكده علوم دریایی با توجه به گستره و تنوع فعالیتهای تحقیقاتی خود در قالب گروه های تحقیقاتی زیر به فعالیت می پردازد: